PCR實驗室又叫基因擴增實驗室。PCR是聚合酶鏈式反應(Polymerase Chain Reaction)的簡稱。是一種分子生物學技術，用于放大特定的DNA片段，可看作生物體外的特殊DNA復制。通過DNA基因追蹤系統，能迅速掌握患者體內的病毒含量，其精確度高達納米級別。
1、原始試劑混配室應為正壓間，在微環境百級超凈臺內操作，須防止其它程序功能間對本操作間的污染。
2、DNA提取室應為微負壓間，須設置排風系統，以防止核酸提取時可能產生的氣溶膠對人員的侵害和對其它程序功能間的擴散污染。
3、PCR擴增室應為微負壓間，須設置排風系統，以防止大量擴增產物對其它程序功能間的擴散污染。
4、檢測室應為微負壓間，須設置排風系統，以防止擴增產物在電泳測序過程中的擴散污染。同時因3130分析儀散熱量較大，會提高室內溫度3-5℃。
5、試劑混配室、DNA提取室、PCR擴增室、檢測室如設置緩沖間，功能間內可均為正壓，而在緩沖間內設置負壓，氣流從其雙道門的門縫處分別向緩沖間內流動，用合理的氣流組織方式避免各功能間的交叉污染。
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