PCR實驗室又叫基因擴增實驗室。能夠通過DNA基因追蹤系統來掌握患者體內的病毒含量。它最大特點是具有較大擴增能力與極高的靈敏性,但令人頭痛的問題是容易污染,極其微量的污染即可造成假陽性的產生。那么PCR實驗室的污染來源及控制措施都有哪些呢?
一、PCR實驗室被污染的原因
1、標本間交叉污染
標本污染主要有收集標本的容器被污染,或標本放置時,由于密封不嚴溢于容器外,或容器外粘有標本而造成相互間交叉污染。標本核酸模板在提取過程中,由于吸樣槍污染導致標本間污染。有些微生物標本尤其是病毒可隨氣溶膠或形成氣溶膠而擴散,導致彼此間的污染。
2、PCR試劑的污染
主要是由于在PCR試劑配制過程中,由于加樣槍、容器、雙蒸水及其它溶液被PCR核酸模板污染。
3、PCR擴增產物污染
這是PCR反應中最主要最常見的污染問題,因為PCR產物拷貝量大(一般為1013拷貝/mL),遠遠高于PCR檢測數個拷貝的極限,所以極微量的PCR產物污染,就可造成假陽性。
4、實驗室中克隆質粒的污染
在分子生物學實驗室及某些用克隆質粒做陽性對照的檢驗室,這個問題也比較常見。因為克隆質粒在單位容積內含量相當高,另外在純化過程中需用較多的用具及試劑,而且在活細胞內的質粒,由于活細胞的生長繁殖的簡便性及具有很強的生命力,其污染可能性也很大。
二、防止污染的方法
進行PCR操作時,操作人員應該嚴格遵守一些操作規程,最大程度地降低可能出現的PCR污染或杜絕污染的出現。
(一) 劃分操作區:目前,普通PCR尚不能做到單人單管,實現完全閉管操作,但無論是否能夠達到單人單管,均要求實驗操作在三個不同的區域內進行,PCR的前處理和后處理要在不同的隔離區內進行:
1、試劑準備區。
2、標本制備區。
3、PCR擴增區及分析區。
各工作區要有一定的隔離,操作器材專用,要有一定的方向性。如:試劑準備→標準制備→PCR擴增區及分析區。
切記:任何一間的產物及器材不要拿到其他兩個工作區。
(二) 分裝試劑:PCR擴增所需要的試劑均應在生物安全柜、裝有紫外燈的超凈工作臺或負壓工作臺配制和分裝。所有的加樣器和吸頭需固定放于其中,不能用來吸取擴增后的DNA和其他來源的DNA:
1、PCR用水應為高壓的雙蒸水。
2、引物和dNTP用高壓的雙蒸水在無PCR擴增產物區配制。
3、引物和dNTP應分裝儲存,分裝時應標明時間,以備發生污染時查找原因。
(三) 實驗操作注意事項
盡管擴增序列的殘留污染大部分是假陽性反應的原因,樣品間的交叉污染也是原因之一。因此,不僅要在進行擴增反應是謹慎認真,在樣品的收集、抽提和擴增的所有環節都應該注意:
1、戴一次性手套,若不小心濺上反應液,立即更換手套。
2、使用一次性吸頭,嚴禁與PCR產物分析室的吸頭混用,吸頭不要長時間暴露于空氣中,避免氣溶膠的污染。
3、避免反應液飛濺,打開反應管時為避免此種情況,開蓋前稍離心收集液體于管底。若不小心濺到手套或桌面上,應立刻更換手套并用稀酸擦拭桌面。
4、操作多份樣品時,制備反應混合液,先將dNTP、緩沖液、引物和酶混合好,然后分裝,這樣即可以減少操作,避免污染,又可以增加反應的精確度。
5、最后加入反應模板,加入后蓋緊反應管。
6、操作時設立陰陽性對照和空白對照,即可驗證PCR反應的可靠性,又可以協助判斷擴增系統的可信性。
7、盡可能用可替換或可高壓處理的加樣器,由于加樣器最容易受產物氣溶膠或標本DNA的污染,最好使用可替換或高壓處理的加樣器。如沒有這種特殊的加樣器,至少PCR操作過程中加樣器應該專用,不能交叉使用,尤其是PCR產物分析所用加樣器不能拿到其它兩個區。
8、重復實驗,驗證結果,慎下結論。
以上就是PCR實驗室的污染來源及控制措施。更多實驗室相關產品信息,敬請關注河南中潤實驗工程公司官網,產品咨詢及實驗室EPC設計建設請聯系網站客服。